英木和

近水樓臺先得月:IMH最新推出Illumina甲基化芯片與甲基化測序服務
2017-08-23

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IMH是Illumina在中國最大的代理商,而且是Illumina在全球為數不多的“精英渠道伙伴”之一。我們已連續四年獲得Illumina頒發的年度杰出銷售成就獎。IMH不僅是專業的基因技術代理銷售平臺,而且從成立之初就致力于為客戶提供從實驗室設計、技術選擇到人員培訓等基因技術領域的整體化解決方案。目前,我們正積極向大健康領域拓展業務,最新推出表觀遺傳學技術服務,包括Illumina甲基化芯片與甲基化測序服務


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DNA甲基化是基因組中一種重要的化學修飾,調節基因的表達與沉默,和發育、衰老,以及癌癥等許多疾病密切相關,是表觀遺傳學研究的重要內容之一。

Ilumina開發了多種基于芯片和基于測序的表觀遺傳分析工具,可為專注于表觀遺傳修飾及其對基因調控之影響的研究人員提供功能強大、簡單易用且經濟高效的解決方案。


甲基化芯片技術服務

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850K甲基化芯片的特點與優勢
依托業界領先的Infinium實驗分析方法,Illumina推出了新一代的DNA甲基化芯片——MethylationEPIC BeadChip,可基于單核苷酸分辨率定量檢測人類全基因組中853,307個甲基化位點(簡稱850K芯片)。850K芯片涵蓋了90%以上的Infinium HumanMethylation450K芯片的位點內容;不但保持了對CpG島、基因啟動子區的全面覆蓋,還特別加強了增強子區(新增333,265個來自ENCODE及FANTOM5的探針)以及基因編碼區的探針,是目前最適合表觀基因組全關聯分析研究(EWAS)的DNA甲基化芯片。


  • 全面的全基因組覆蓋范圍(> 850,000個甲基化位點)
    包括CpG島、非CpG和差異甲基化位點、FANTOM5增強子、ENCODE染色質、ENCODE轉錄因子結合位點、miRNA啟動子區域等
  • 技術性重復重現性>98%
  • 可適用于FFPE樣本
  • DNA起始量低至250 ng

數據分析
IMH提供850K甲基化芯片的基礎分析和可定制的高級分析。基礎分析包括原始數據預處理,數據歸一化,差異甲基化位點及其在染色體上的分布,啟動子區甲基化分析,按基因注釋分類和CpG注釋分類的差異甲基化區域,差異甲基化位點注釋基因的GO分類和KEGG分析等。可定制的高級分析包括甲基化與表達譜的關聯分析,不同基因區段的甲基化水平變化分析,差異甲基化基因中鄰近啟動子區域motif的識別,特定樣本中高甲基化和低甲基化位點的篩選等。


甲基化測序技術服務

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甲基化測序的特點和優勢
胞嘧啶甲基化可能明顯改變基因的時空表達和染色質重塑。全基因組重亞硫酸鹽測序(WGBS)利用新一代測序(NGS)和全基因組分析的力量,提供整個基因組甲基化模式的單堿基分辨率全面視圖。


Illumina為甲基化測序提供了一個全面支持的、從文庫制備到數據分析的流程。在文庫制備過程中,重亞硫酸鹽將未甲基化的胞嘧啶轉化成尿嘧啶。轉化后的堿基在測序中被識別為胸腺嘧啶(PCR后),并通過序列計數來確定甲基化胞嘧啶的比例。


  • 可發現整個基因組中所有CpG、CHH和CHG區域的甲基化模式
  • 能以少量的DNA捕獲全面的樣品多樣性
  • 能查看大多數物種基因組中幾乎每個胞嘧啶的甲基化
  • DNA起始量低至50 ng


數據分析
IMH提供全基因組甲基化測序的基礎分析和可定制的高級分析。基礎分析包括測序數據預處理,轉化效率評估,全基因組比對,CpG/CHG/CHH位點覆蓋率、測序深度、甲基化比例和染色體分布, 差異甲基化位點和甲基化區段篩選, 差異甲基化位點或區段的CpG島注釋和基因注釋,全基因組甲基化圖譜,甲基化和表達譜的聯合分析,GO和KEGG分析等。高級分析將根據用戶的研究需求進行個性化定制。

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